因工作需要， 農產品檢測實驗室可設置如下幾個部分：業務收樣室、 樣品貯藏室、 樣品處理室、 試劑貯藏室、 樣品檢測前處理室、 儀器分析室、 稱量室、 烘干室、 標準溶液配置室、 感官分析室、 品質分析室、 微生物檢測室、 轉基因成分檢測室、 食品毒理分析室等。 每個部分都有基本要求和特殊要求， 業務收樣室主要與客戶打交道， 接收樣品和發送檢測報告， 處理客戶抱怨， 是實驗室工作的窗口，應設置在建筑物的一層靠近門廳的位置或者每層建筑中廳的位置， 總之， 一切以方便客戶為準則。 樣品檢測前處理室主要考慮通風要求。 儀器分析室主要考慮用電負荷、 控溫控濕、 氣路、 地線、 消防手段等要求。 稱量室要考慮氣流穩定、 無振動、 隔離緩沖等要求。 標液配制室要考慮獨立空間、 防止交叉污染等要求。 微生物檢測室、 轉基因成分檢測室、 食品毒理分析室等潔凈區域應滿足國家相關技術規范要求。
實驗室內的水電通風設施是開展檢測工作的基本保障，實驗室應依據每個房間的具體用途不同而進行 合理設計。一般情況下，實驗室用水主要包括實驗冷卻循環用水、儀器用水、配藥用水、洗滌用水、消防用水 等，設計實驗室用水時，應充分考慮檢測項目與工作量的不同，確保水源充足、使用方便。實驗室用電一般分 為照明用電與儀器用電兩部分，二者線路應分開配置，設計房間內電源負荷功率時，應以實際所用儀器負荷 功率總和為基礎，同時考慮將來發展需要，確保電力資源配置充足合理。通風設施是實驗室重要基礎設施， 應依據檢測項目不同而進行合理設計，通風設施的管道材質應具有抗酸抗堿抗腐蝕性，一般情況下，樣品室、 試劑室、前處理室、消煮室等均應配備足夠數量的通風設施，以確保檢測人員人身健康。

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