伴隨著的病理實驗室中產生的廢氣、廢液以及醫療垃圾等有害物質的排放、環境污染和防火等問題同樣受關注。加強實驗室廢氣、廢液和醫療垃圾等的排放、收集和處理等規范和管理工作，有利于改善工作環境，避免環境污染，維護公共安全和保障實驗室工作人員的身體健康。

病理實驗室建設之環境設計：
病理實驗室的工作區域主要分為污染區、半污染區和非污染區，這些區域應明確分開做到既相互聯系又互不干擾和污染。 
（1）污染區：污染源主要是臨床送檢的標本和屬于危險品的化學試劑。接收送檢的標本的收發室、取材室、儲存室、冰凍切片制作室、細胞學涂片制作室和尸 檢解剖室都屬于污染區，應安裝紫外燈等消毒裝置，每天進行消毒；安裝良好的通風設施，將甲醛等有害廢氣排出。 
（2）半污染區：污染源主要屬于危險品的化學試劑。制片技術室包括組織處理實驗室、組織包埋實驗室、石蠟組織切片室、HE染色和其他染色實驗室以及一些相關技術實驗室、病理診斷室、組織切片和蠟塊儲存室、大體標本制作室和陳列室等屬于半污染區，應安裝良好的通風設施，將有害廢氣排出。 
（3）非污染區：非污染區不應有生物性和化學性的污染物存在，但也應該安裝良好的通風設施，保持室內空氣新鮮。（文字檔案室、攝影室、辦公室和休息室等屬于非污染區）
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